A decisão surge depois de o nome do general ter surgido envolvido num caso de troca de correspondência com uma mulher casada, apanhada no escândalo que resultou na demissão do general David Petraeus do cargo de diretor da CIA. .John Allen, de 60 anos, renuncia assim a um dos cargos mais importantes do exército norte-americano, obrigando a Casa Branca e o Pentágono a encontrar um substituto. .Até ao momento, ainda não surgiu nenhum nome para o cargo, tradicionalmente entregue a um oficial norte-americano e atualmente ocupado pelo almirante James Stavridis. O anúncio da reforma de Allen surge a dois dias de uma reunião dos ministros da Defesa dos 28 países da aliança, em Bruxelas. ."Hoje, encontrei-me com o general John Allen e aceitei o seu pedido de passar à reforma de forma a ocupar-se de problemas de saúde no seio da sua família", afirmou o Presidente dos EUA, Barack Obama, num comunicado. .O general Allen terminou há dez dias um destacamento de 19 meses em Cabul, onde liderou a coligação internacional no Afeganistão (Isaf). Tinha sido nomeado em meados de novembro para dirigir as forças americanas na Europa e as da Nato, mas a sua nomeação tinha sido suspensa por causa da investigação ao escândalo que custou o cargo a Petraeus..Os emails encotnrados no computador de uma mulher casada, Jill Kelley, ligada ao escândalo Petraeus, mostravam uma correspondência desta com Allen, suspeitando-se de uma relação entre ambos. Depois do inquérito, o Pentágono "exonerou totalmente" o general de qualquer conduta imprópria para um oficial ou violação das regras militares, abrindo caminho à sua nomeação.