Os funcionários públicos descontam todos os meses 3,5% do seu salário para a ADSE - seja os que obrigatoriamente foram inscritos neste subsistema de saúde, seja os que a ele aderiram voluntariamente. Para o IRS, este desconto não é considerado uma despesa de saúde, sendo antes somado à chamada dedução específica, isto é, aos descontos para a Caixa Geral de Aposentações ou segurança social.