Eva Carneiro esteve no centro de uma polémica, que também envolveu José Mourinho, em 2015, quando deixou de fazer parte da equipa médica do Chelsea, equipa que o português orientava. O técnico não gostou de uma entrada da equipa médica em campo durante um encontro frente ao Swansea e foi criticada por Mourinho. Não só acabou por sair do clube, como o processo seguiu para os tribunais e o clube foi, inclusivamente, obrigado a pedir desculpas à médica..Depois de uma saída polémica da equipa londrina, Eva Carneiro esteve sem ver jogos durante um ano. "Sinceramente, foi difícil ver um jogo de futebol durante um ano. Só vi a final da Liga dos Campeões [Real Madrid e Atlético Madrid]", afirmou ao francês L'Équipe..Sobre toda a polémica, diz que lidou com tudo da "melhor maneira" que conseguiu. "Foi um choque numa altura em que devia estar feliz, porque ia casar-me e ir de lua-de-mel", acrescentou..Revelou ainda que já teve várias ofertas para voltar ao futebol, mas que ainda não resolveu consumar esse regresso por opção própria.